Był mężem Błęckiej-Kolskiej. Jego siostra zmarła na korytarzu wytwórni filmowej
Jan Jakub Kolski, znany reżyser filmowy, w swoim życiu przeżył kilka osobistych tragedii. W 1999 roku stracił siostrę, znaną montażystkę Ewę Pakulską. 15 lat później w wypadku zginęła jego 23-letnia córka, Zuzanna.